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哈尔滨医科大学人类癌症中小分子和miRNA关联关系
在哈尔滨医科大学李霞教授带领的生物信息团队与博士后姜伟副教授的共同努力下,2012年2月《Nature》子刊《科学报导》(Scientific Reports)发表了这个研究团队题为“基于转录反应识别人类癌症中小分子和miRNA关联”的科研论文。
miRNA是一种单链的非编码RNA,参与多种与人类癌症密切相关的生物学过程,如细胞增殖、分化、凋亡等。近年的研究发现miRNA能够被化学小分子所靶向,并受到了越来越多的关注,利用小分子化合物靶向miRNA将成为一种新型的癌症治疗方法。该研究是首次利用生物信息学方法高通量识别人类癌症中小分子化合物与miRNA间的关联关系。基于小分子扰动的基因芯片数据、癌症中的差异表达基因以及miRNA所调控的靶基因等信息,在17种人类癌症中构建了小分子和miRNA的关联网络。
研究团队通过对网络的分析,确定了小分子模块和miRNA模块的功能特点,并成功应用于候选药物的筛选以及药物的重新定位。研究结果发现曲古抑菌素A(TSA)可能具有广谱抗癌的作用,TSA与miR-19a、miR-19b、miR-23b的关联关系在所有癌症中出现的频率最高。通过对这三个miRNA共同的靶基因进行通路分析发现,它们显著富集在了MAPK信号通路和mTOR信号通路中,这提示我们TSA可能通过调控这两个信号通路发挥抗癌作用;此外,分析结果还提示,2-脱氧-D-葡萄糖(2DOG)具有成为候选抗癌药物的潜力,雌二醇可能具有抗炎活性等。该研究的成果将极大地加快miRNA相关药物的研发,为癌症的治疗提供更加安全、高效的候选药物,同时,也将对癌症患者的个性化医疗提供重要的参考和帮助。